Строительство боевых кораблей, ставшее основной послевоенной специализацией завода «Янтарь», имеет давние и прочные традиции. Оборонная продукция завода хорошо известна нескольким поколениям моряков всех флотов бывшего СССР и сегодняшней России, а также ряду зарубежных стран своим качеством, надежностью и высокой боевой эффективностью.
Всего за период с 1949 по 2011 г. г. для ВМФ было построено 154 корабля. Среди них:

• Cторожевые корабли проекта 29 (3 ед.), пр. 42 (7 ед.), пр. 50 (41ед.), пр. 11540 (2 ед.);
• Противолодочные корабли пр. 159 (24 ед.), пр. 35 (18 ед.), пр. 1135 «Буревестник» (19 ед.), проекты 1155, 1155.1 «Фрегат» (9 ед.);
• Большие десантные корабли проекта 1171 «Тапир» (14 ед.) и пр. 1174 «Носорог» (3 ед.);
• Корабли космической связи пр. 1826 «Рубидий» (3 ед.).

В 2008 году ОАО «ПСЗ «Янтарь» вошел в состав Объединённой судостроительной корпорации. В 2009 году завод сдал два заказа – природоохранное судно «Спрут», построенное для Пограничной службы ФСБ России, и сторожевой корабль «Ярослав Мудрый» - для ВМФ России. Главными заказчиками в военной сфере сегодня выступают ВМФ России и ВМС Индии.

В настоящее время в постройке находятся:

• Большой десантный корабль «Иван Грен» пр. 11711 разработки ОАО «Невское ПКБ»;
• Опытовое судно для проведения испытаний «Селигер» пр. 11982, разработанного ОАО «ЦМКБ «Алмаз», закладка судна состоялась 8 июля 2009г.
• По линии военно-технического сотрудничества ОАО ПСЗ «Янтарь» строит для ВМС Индии серию фрегатов проекта 11356 разработки ОАО «Северное ПКБ».